Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BUD23O43709 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BUD23O43709 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BUD23O43709 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BUD23O43709 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BUD23O43709 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BUD23O43709 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BUD23O43709 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BUD23O43709 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BUD23O43709 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BUD23O43709 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BUD23O43709 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BUD23O43709 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BUD23O43709 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BUD23O43709 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BUD23O43709 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BUD23O43709 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BUD23O43709 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BUD23O43709 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BUD23O43709 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BUD23O43709 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BUD23O43709 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BUD23O43709 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BUD23O43709 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BUD23O43709 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BUD23O43709 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BUD23O43709 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BUD23O43709 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BUD23O43709 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BUD23O43709 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BUD23O43709 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BUD23O43709 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BUD23O43709 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BUD23O43709 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BUD23O43709 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BUD23O43709 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BUD23O43709 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BUD23O43709 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BUD23O43709 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BUD23O43709 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BUD23O43709 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BUD23O43709 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BUD23O43709 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BUD23O43709 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BUD23O43709 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BUD23O43709 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BUD23O43709 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BUD23O43709 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BUD23O43709 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BUD23O43709 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BUD23O43709 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BUD23O43709 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BUD23O43709 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BUD23O43709 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BUD23O43709 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BUD23O43709 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BUD23O43709 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BUD23O43709 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BUD23O43709 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BUD23O43709 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BUD23O43709 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BUD23O43709 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BUD23O43709 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BUD23O43709 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BUD23O43709 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BUD23O43709 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BUD23O43709 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BUD23O43709 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BUD23O43709 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BUD23O43709 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BUD23O43709 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BUD23O43709 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BUD23O43709 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BUD23O43709 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BUD23O43709 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BUD23O43709 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BUD23O43709 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BUD23O43709 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BUD23O43709 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BUD23O43709 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BUD23O43709 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BUD23O43709 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BUD23O43709 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BUD23O43709 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BUD23O43709 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BUD23O43709 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BUD23O43709 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BUD23O43709 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BUD23O43709 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BUD23O43709 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BUD23O43709 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BUD23O43709 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BUD23O43709 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BUD23O43709 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BUD23O43709 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BUD23O43709 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BUD23O43709 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms