Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CBFA2T2O43439 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBFA2T2O43439 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBFA2T2O43439 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CBFA2T2O43439 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CBFA2T2O43439 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms