Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCP110O43303 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCP110O43303 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCP110O43303 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCP110O43303 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCP110O43303 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCP110O43303 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCP110O43303 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCP110O43303 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCP110O43303 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCP110O43303 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCP110O43303 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCP110O43303 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCP110O43303 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCP110O43303 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCP110O43303 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCP110O43303 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCP110O43303 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCP110O43303 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCP110O43303 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCP110O43303 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCP110O43303 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCP110O43303 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCP110O43303 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCP110O43303 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCP110O43303 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCP110O43303 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCP110O43303 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCP110O43303 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCP110O43303 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCP110O43303 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCP110O43303 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCP110O43303 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCP110O43303 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCP110O43303 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCP110O43303 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCP110O43303 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCP110O43303 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCP110O43303 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCP110O43303 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCP110O43303 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCP110O43303 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCP110O43303 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCP110O43303 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCP110O43303 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCP110O43303 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCP110O43303 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCP110O43303 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCP110O43303 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCP110O43303 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCP110O43303 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCP110O43303 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCP110O43303 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCP110O43303 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCP110O43303 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCP110O43303 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCP110O43303 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCP110O43303 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCP110O43303 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCP110O43303 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCP110O43303 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCP110O43303 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCP110O43303 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCP110O43303 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCP110O43303 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCP110O43303 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCP110O43303 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCP110O43303 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCP110O43303 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCP110O43303 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCP110O43303 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCP110O43303 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCP110O43303 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCP110O43303 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCP110O43303 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCP110O43303 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCP110O43303 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCP110O43303 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCP110O43303 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCP110O43303 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCP110O43303 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCP110O43303 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCP110O43303 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCP110O43303 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCP110O43303 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCP110O43303 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCP110O43303 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCP110O43303 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCP110O43303 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCP110O43303 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCP110O43303 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCP110O43303 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCP110O43303 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCP110O43303 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCP110O43303 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCP110O43303 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCP110O43303 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCP110O43303 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCP110O43303 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCP110O43303 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms