Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARPC5O15511 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ARPC5O15511 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARPC5O15511 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARPC5O15511 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms