Protein–RNA interactions for Protein: O15119

TBX3, T-box transcription factor TBX3, humanhuman

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX3O15119 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TBX3O15119 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TBX3O15119 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TBX3O15119 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TBX3O15119 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TBX3O15119 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TBX3O15119 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TBX3O15119 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TBX3O15119 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TBX3O15119 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TBX3O15119 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TBX3O15119 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TBX3O15119 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TBX3O15119 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TBX3O15119 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TBX3O15119 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TBX3O15119 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TBX3O15119 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TBX3O15119 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TBX3O15119 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TBX3O15119 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TBX3O15119 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TBX3O15119 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TBX3O15119 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TBX3O15119 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TBX3O15119 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TBX3O15119 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TBX3O15119 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TBX3O15119 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TBX3O15119 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TBX3O15119 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TBX3O15119 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TBX3O15119 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TBX3O15119 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TBX3O15119 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TBX3O15119 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TBX3O15119 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TBX3O15119 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TBX3O15119 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TBX3O15119 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TBX3O15119 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TBX3O15119 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TBX3O15119 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TBX3O15119 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TBX3O15119 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TBX3O15119 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TBX3O15119 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TBX3O15119 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TBX3O15119 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TBX3O15119 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TBX3O15119 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TBX3O15119 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TBX3O15119 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TBX3O15119 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TBX3O15119 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TBX3O15119 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TBX3O15119 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TBX3O15119 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TBX3O15119 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TBX3O15119 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TBX3O15119 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TBX3O15119 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TBX3O15119 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TBX3O15119 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TBX3O15119 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TBX3O15119 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TBX3O15119 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TBX3O15119 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TBX3O15119 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TBX3O15119 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TBX3O15119 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TBX3O15119 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TBX3O15119 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TBX3O15119 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TBX3O15119 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TBX3O15119 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TBX3O15119 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TBX3O15119 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TBX3O15119 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TBX3O15119 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TBX3O15119 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TBX3O15119 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TBX3O15119 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TBX3O15119 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TBX3O15119 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TBX3O15119 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TBX3O15119 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TBX3O15119 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TBX3O15119 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TBX3O15119 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TBX3O15119 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TBX3O15119 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TBX3O15119 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TBX3O15119 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TBX3O15119 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TBX3O15119 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TBX3O15119 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TBX3O15119 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TBX3O15119 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TBX3O15119 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms