Protein–RNA interactions for Protein: O14526

FCHO1, F-BAR domain only protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1O14526 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FCHO1O14526 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FCHO1O14526 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCHO1O14526 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCHO1O14526 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms