Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBAG9O00559 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBAG9O00559 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EBAG9O00559 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBAG9O00559 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBAG9O00559 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.1 ms