Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
O00370 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
O00370 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
O00370 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
O00370 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
O00370 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
O00370 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
O00370 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
O00370 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
O00370 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
O00370 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
O00370 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
O00370 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
O00370 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
O00370 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
O00370 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
O00370 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
O00370 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
O00370 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
O00370 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
O00370 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
O00370 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
O00370 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
O00370 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
O00370 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
O00370 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
O00370 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
O00370 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
O00370 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
O00370 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
O00370 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
O00370 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
O00370 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
O00370 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
O00370 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
O00370 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
O00370 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
O00370 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
O00370 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
O00370 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
O00370 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
O00370 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
O00370 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
O00370 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
O00370 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
O00370 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
O00370 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
O00370 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
O00370 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
O00370 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
O00370 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
O00370 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
O00370 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
O00370 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
O00370 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
O00370 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
O00370 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
O00370 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
O00370 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
O00370 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
O00370 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
O00370 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
O00370 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
O00370 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
O00370 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
O00370 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
O00370 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
O00370 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
O00370 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
O00370 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
O00370 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
O00370 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
O00370 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
O00370 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
O00370 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
O00370 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
O00370 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
O00370 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
O00370 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
O00370 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
O00370 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
O00370 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
O00370 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
O00370 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
O00370 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
O00370 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
O00370 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
O00370 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
O00370 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
O00370 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
O00370 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
O00370 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
O00370 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
O00370 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
O00370 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
O00370 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
O00370 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
O00370 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
O00370 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
O00370 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms