Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HIP1O00291 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HIP1O00291 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HIP1O00291 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HIP1O00291 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HIP1O00291 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HIP1O00291 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HIP1O00291 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HIP1O00291 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HIP1O00291 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HIP1O00291 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIP1O00291 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIP1O00291 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIP1O00291 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HIP1O00291 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HIP1O00291 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
HIP1O00291 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIP1O00291 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIP1O00291 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIP1O00291 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIP1O00291 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIP1O00291 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIP1O00291 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIP1O00291 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIP1O00291 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIP1O00291 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIP1O00291 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIP1O00291 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIP1O00291 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIP1O00291 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIP1O00291 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIP1O00291 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIP1O00291 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIP1O00291 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIP1O00291 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIP1O00291 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HIP1O00291 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIP1O00291 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIP1O00291 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIP1O00291 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIP1O00291 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIP1O00291 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIP1O00291 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIP1O00291 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIP1O00291 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIP1O00291 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HIP1O00291 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIP1O00291 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIP1O00291 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIP1O00291 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIP1O00291 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIP1O00291 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIP1O00291 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIP1O00291 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIP1O00291 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIP1O00291 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIP1O00291 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIP1O00291 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIP1O00291 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIP1O00291 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIP1O00291 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HIP1O00291 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIP1O00291 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIP1O00291 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIP1O00291 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIP1O00291 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
HIP1O00291 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIP1O00291 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIP1O00291 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIP1O00291 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIP1O00291 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HIP1O00291 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIP1O00291 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIP1O00291 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIP1O00291 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HIP1O00291 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIP1O00291 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HIP1O00291 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HIP1O00291 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIP1O00291 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIP1O00291 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIP1O00291 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HIP1O00291 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIP1O00291 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIP1O00291 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIP1O00291 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIP1O00291 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HIP1O00291 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIP1O00291 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIP1O00291 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIP1O00291 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HIP1O00291 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIP1O00291 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIP1O00291 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIP1O00291 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIP1O00291 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIP1O00291 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIP1O00291 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIP1O00291 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HIP1O00291 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms