Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVH48-1M5A8F1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVH48-1M5A8F1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVH48-1M5A8F1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVH48-1M5A8F1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVH48-1M5A8F1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVH48-1M5A8F1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVH48-1M5A8F1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVH48-1M5A8F1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVH48-1M5A8F1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVH48-1M5A8F1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERVH48-1M5A8F1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ERVH48-1M5A8F1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms