Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
E9PBE3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PBE3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PBE3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PBE3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PBE3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PBE3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PBE3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PBE3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PBE3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PBE3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PBE3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PBE3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PBE3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PBE3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PBE3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PBE3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PBE3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PBE3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PBE3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PBE3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PBE3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PBE3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PBE3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PBE3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PBE3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PBE3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PBE3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PBE3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PBE3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PBE3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PBE3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PBE3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PBE3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PBE3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PBE3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E9PBE3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E9PBE3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PBE3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PBE3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PBE3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PBE3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PBE3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E9PBE3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PBE3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PBE3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PBE3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PBE3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PBE3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PBE3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PBE3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PBE3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E9PBE3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PBE3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PBE3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PBE3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PBE3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PBE3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E9PBE3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PBE3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PBE3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PBE3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PBE3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E9PBE3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PBE3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PBE3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PBE3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PBE3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E9PBE3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E9PBE3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
E9PBE3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PBE3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E9PBE3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PBE3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PBE3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PBE3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E9PBE3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PBE3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PBE3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PBE3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PBE3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E9PBE3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PBE3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PBE3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
E9PBE3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PBE3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PBE3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PBE3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PBE3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PBE3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PBE3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PBE3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PBE3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E9PBE3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PBE3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E9PBE3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PBE3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PBE3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PBE3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E9PBE3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms