Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L21D6R901 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L21D6R901 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L21D6R901 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP17L21D6R901 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP17L21D6R901 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L21D6R901 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP17L21D6R901 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L21D6R901 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L21D6R901 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms