Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRDCB7Z8K6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRDCB7Z8K6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRDCB7Z8K6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms