Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF487B1APH4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF487B1APH4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF487B1APH4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms