Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A8MVJ9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A8MVJ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A8MVJ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A8MVJ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A8MVJ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A8MVJ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A8MVJ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A8MVJ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A8MVJ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A8MVJ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A8MVJ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A8MVJ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A8MVJ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A8MVJ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A8MVJ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A8MVJ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A8MVJ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A8MVJ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A8MVJ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A8MVJ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A8MVJ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A8MVJ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A8MVJ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A8MVJ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A8MVJ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A8MVJ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A8MVJ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A8MVJ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A8MVJ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A8MVJ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A8MVJ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A8MVJ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A8MVJ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A8MVJ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A8MVJ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A8MVJ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A8MVJ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A8MVJ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A8MVJ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A8MVJ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A8MVJ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A8MVJ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A8MVJ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A8MVJ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A8MVJ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A8MVJ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A8MVJ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A8MVJ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A8MVJ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A8MVJ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A8MVJ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A8MVJ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A8MVJ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A8MVJ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A8MVJ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A8MVJ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A8MVJ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A8MVJ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A8MVJ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A8MVJ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A8MVJ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A8MVJ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A8MVJ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A8MVJ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A8MVJ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A8MVJ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A8MVJ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A8MVJ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A8MVJ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A8MVJ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A8MVJ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A8MVJ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A8MVJ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A8MVJ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A8MVJ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A8MVJ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A8MVJ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A8MVJ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A8MVJ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A8MVJ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A8MVJ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A8MVJ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A8MVJ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A8MVJ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A8MVJ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A8MVJ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A8MVJ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A8MVJ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A8MVJ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A8MVJ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A8MVJ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A8MVJ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A8MVJ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A8MVJ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A8MVJ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A8MVJ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A8MVJ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A8MVJ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A8MVJ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms