Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOTOA8MTQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOTOA8MTQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms