Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KNCNA6PVL3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KNCNA6PVL3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KNCNA6PVL3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1135.8 ms