Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8B2A6NJW9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD8B2A6NJW9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8B2A6NJW9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms