Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WIPF3A6NGB9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WIPF3A6NGB9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WIPF3A6NGB9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms