Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
VPS37CA5D8V6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VPS37CA5D8V6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS37CA5D8V6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms