Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM72A0PK05 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM72A0PK05 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM72A0PK05 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms