Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1C5

CYP2D7, Putative cytochrome P450 2D7, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2D7A0A087X1C5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2D7A0A087X1C5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2D7A0A087X1C5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2D7A0A087X1C5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2D7A0A087X1C5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2D7A0A087X1C5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2D7A0A087X1C5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYP2D7A0A087X1C5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CYP2D7A0A087X1C5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYP2D7A0A087X1C5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP2D7A0A087X1C5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP2D7A0A087X1C5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP2D7A0A087X1C5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP2D7A0A087X1C5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP2D7A0A087X1C5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP2D7A0A087X1C5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP2D7A0A087X1C5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms