Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A087X1B8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A087X1B8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087X1B8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms