Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms