Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y4

PYGO1, Pygopus homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO1Q9Y3Y4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PYGO1Q9Y3Y4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PYGO1Q9Y3Y4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms