Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms