Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FARSAQ9Y285 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms