Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms