Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF8Q9UPP1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms