Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRXN1Q9ULB1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms