Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GMEB2Q9UKD1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms