Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FBXL4Q9UKA2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FBXL4Q9UKA2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms