Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGA2Q9UJY4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms