Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYTH4Q9UIA0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYTH4Q9UIA0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms