Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS7AQ9UBW8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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