Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL13Q9P2N7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL13Q9P2N7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms