Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL42Q9P2K6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms