Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms