Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms