Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms