Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJB4Q9NTQ9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB4Q9NTQ9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms