Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE7BQ9NP56 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE7BQ9NP56 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE7BQ9NP56 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE7BQ9NP56 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE7BQ9NP56 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE7BQ9NP56 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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