Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELL3Q9HB65 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELL3Q9HB65 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms