Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEBOXQ9HB31 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEBOXQ9HB31 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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