Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIRIP3Q9BW71 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms