Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms