Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms