Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms