Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP9Q99956 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP9Q99956 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms