Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIN3AQ96ST3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms